Användbara anteckningar om epitop av immunogener

Användbara anteckningar om epitop av immunogener!

De flesta immunogenerna består av många typer av molekyler.

Dock fungerar endast få av dessa molekyler som immunogen. Även inom en enda immunogen molekyl riktas inte immunsvaret mot hela molekylen, utan endast mot några aminosyrarester i molekylen.

Satsen av aminosyror som känns igen av immunoglobulinet eller T-cellreceptorn (TCR) kallas en epitop (tidigare kallad en antigen determinant). En enda immunogen molekyl kan ha en eller flera olika epitops (figur 6.1).

Fig. 6.1: Diagram för att visa närvaron av olika epitoper i ett antigen.

I detta diagram visas tre olika epitoper i ett antigen. Peptidepitoperna skiljer sig från varandra med aminosyrasekvenser och följaktligen skiljer de sig i deras tredimensionella struktur. Eftersom epitoper skiljer sig från varandra skiljer sig antikropparna som induceras mot epitoperna emellan. Ytimmunoglobulinet (slg; B-cellreceptorn) på en B-cell binder till en epitop och bindningen sker mellan epitopaminosyrorna och de komplementära aminosyrasekvensema i den hypervariabla regionen i slg.

Aminosyraresterna av protein tenderar att vikas i kompakta massor. Det övergripande vikningsmönstret för varje protein är styvt. Så upptagna aminosyrarester exponerade på ytan av den vikta massan fasta ställen i förhållande till varandra. Röntgenkristallogram har visat att antikroppar kommer i kontakt med aminosyraresterna på ytan av ett proteinantigen. Antalet aminosyror med vilka varje antikroppskontakt varierar från 3-20.

jag. I många fall ligger alla aminosyrarester av en epitop linjärt. Sådana epitoper kallas linjära (eller sekventiella) epitoper. Värmedetaturering förändrar inte positionerna hos resterna i en linjär epitop. Följaktligen, även efter uppvärmning, kombinerar de linjära epitoperna med motsvarande antikroppar (fig 6.2).

ii. Vissa epitoper bildas inte av linjära aminosyror. På grund av den vikande naturen hos aminosyrakedjan kommer aminosyrorna från olika ställen i kedjan närmare varandra. En epitop kan bildas av aminosyror från olika delar av polypeptidkedjan och ligger nära varandra. Denna typ av epitop kallas konformationsepitop.

Aminosyraresterna som utgör konformationsepitopen är långt ifrån varandra i den primära aminosyrasekvensen men placeras nära varandra i den tertiära strukturen. När ett protein med konformationsepitop värms upp, uppträder denaturering av proteinkedjan och aminosyrakedjan förlorar den tredimensionella vikningen. Aminosyrorna, som bildade epitopen, separeras från varandra på grund av värme och följaktligen förloras epitopen. Därför kan antikropparna som bildas mot konformationsepitopen inte binde till det denaturerade antigenet (fig 6.2).